Le Bureau est l’organe de gestion et d’administration de l’Académie qui met en œuvre les décisions de l’Assemblée générale. Il comprend un (1) Président, cinq (5) Vice-présidents qui sont les Présidents des Collèges, un (1) Secrétaire perpétuel, un (1) Secrétaire perpétuel adjoint, un (1) Trésorier et un (1) Trésorier adjoint qui sont élus en Assemblée générale. Le Président a rang de président d’institution. Sa nomination tout comme celles des Vice-présidents et du Secrétaire perpétuel sont faites par décrets pris en Conseil des ministres après leurs élections par l’Assemblée générale.

Président
Prof Arouna OUEDRAOGO
Membre fondateur, Spécialité: Psychiatrie
Vice-Président, Président Collège Sciences Juridiques, Politiques, Economiques et de Gestion
Prof Filiga Michel SAWADOGO
Membre fondateur, Spécialité: Sciences juridiques
Vice-Présidente, Présidente Collège Sciences Naturelles et Agricoles
Prof Chantal ZOUNGRANA/KABORE
Membre fondateur, Spécialité: Productions animales
Vice-Président, Président Collège Sciences et Techniques
Prof Stanislas OUARO
Membre fondateur, Président du Collège ST, spécialité Mathématiques pures et Appliquées
Vice-Président, Président Collège Sciences Humaines, Arts, Lettres et Culture
Prof Joseph PARE
Membre fondateur, Spécialité: Sémiotique
Vice-Présidente, Président Collège Sciences de la Santé Humaine et Animale
Prof Diarra YE/OUATTARA
Membre Fondateur, présidente du Collège SSHA, spécialité Pédiatrie
Secrétaire Perpétuelle
Prof Yvonne Libona BONZI-COULIBALY
,Membre fondateur, spécialité Chimie-Substances naturelles-Environnement
Secrétaire Perpétuel Adjoint
Prof Blami DAO
Membre fondateur Spécialité Gynécologie obstétrique
Trésorier
Prof Idrissa OUEDRAOGO
Membre élu , Trésorier, Spécialité Sciences économiques
Trésorier Adjoint
Prof Antoine SANON
Membre élu, Spécialité Biologie Animale